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空间转录组分析工具-seurat介绍
什么是空间转录组(ST)?以市面上最流行的10X为例:将冰冻组织切片(FF)或石蜡切片(FFPE)放置在10X Genomics Visium芯片的捕获区域内,进行HE染色和成像后,对组织切片进行透化处理,细胞内的mRNA释放出来,从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获,并且每个探针都带有特异的位置序列,然后以mRNA为模版进行cDNA合成,构建文库后再通过测序,获得基因表达信息的同时,每一条测序reads因带有位置序列,从而能够获得基因表达的位置信息。
넶124 2024-05-17
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病理图片不清晰?一招解决!
在科研论文中,我们经常会用到病理图片,比如HE染色、免疫组化、免疫荧光等,由于拍摄/扫描仪器设备性能不同、个人主观因素等原因,导致病理图片出现亮度不足、对比不足、色偏等现象,从而使得图片看起来不清晰。我们通过使用Adobe Photoshop软件的一个小功能,使图片马上变清晰。
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如何检测人体内的微塑料
由于塑料的广泛使用及不易降解(通常需要数百年的时间),塑料污染已是一个全球关注的问题,仅在 2020 年,就有 3.67 亿吨塑料被生产并使用[1]。通常塑料不会被人体直接吸收,随着检测手段的进步,科学家发现生产过程中小于5毫米的微塑料,或者被热力、氧化、生物降解等过程分解成的微纳米塑料颗粒(Micro- and nano-plastic particles,MNPs)都会被生物体吸收。
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空间转录组分析工具-seurat介绍
什么是空间转录组(ST)?以市面上最流行的10X为例:将冰冻组织切片(FF)或石蜡切片(FFPE)放置在10X Genomics Visium芯片的捕获区域内,进行HE染色和成像后,对组织切片进行透化处理,细胞内的mRNA释放出来,从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获,并且每个探针都带有特异的位置序列,然后以mRNA为模版进行cDNA合成,构建文库后再通过测序,获得基因表达信息的同时,每一条测序reads因带有位置序列,从而能够获得基因表达的位置信息。
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动物组织标本病理检测的取材与保存方法
在科研动物实验中,经常涉及到动物组织的病理检测。然而,在做病理检测之前,往往容易忽视对组织标本的正确取材与保存。因此,根据病理检测方法不同,我整理了以下几点建议,以提高实验数据的有效性。
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科学论文投稿之图片保存方法
在科学论文投稿过程中,常常需要对图片进行组合、编辑和添加标注等操作。通常这些操作发生在实验已经完成的阶段,如果在选图过程中发现图片模糊、缺少标尺或视野不合适,再进行实验就为时已晚。因此,我给大家整理了以下几点关于科研实验图片保存的建议。
넶81 2024-05-14 -
科学论文投稿之图片分辨率、图片宽度与文件大小
在科学论文投稿过程中,期刊通常对所提交的图片有一些要求,其中包括图片的分辨率、宽度和高度以及文件大小等方面。为了满足这些要求,需要考虑多个因素。下面将对这些概念进行解释,介绍它们之间的关系,并提供处理不符合要求情况的建议。
넶106 2024-05-14 -
科学论文投稿常见的图片格式
图片是科学论文的重要组成部分,在投稿过程中会遇到编辑对图片格式各种各样的要求,那么论文常用的图片格式有哪些?这些图片格式有什么特点?在插图制作或者投稿过程中该如何选择图片格式呢?接下来,小编同大家聊一聊这个知识点。
넶98 2024-05-14
- 2024-04-07
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如何检测人体内的微塑料
由于塑料的广泛使用及不易降解(通常需要数百年的时间),塑料污染已是一个全球关注的问题,仅在 2020 年,就有 3.67 亿吨塑料被生产并使用[1]。通常塑料不会被人体直接吸收,随着检测手段的进步,科学家发现生产过程中小于5毫米的微塑料,或者被热力、氧化、生物降解等过程分解成的微纳米塑料颗粒(Micro- and nano-plastic particles,MNPs)都会被生物体吸收。
넶96 2024-05-24 -
空间转录组分析工具-seurat介绍
什么是空间转录组(ST)?以市面上最流行的10X为例:将冰冻组织切片(FF)或石蜡切片(FFPE)放置在10X Genomics Visium芯片的捕获区域内,进行HE染色和成像后,对组织切片进行透化处理,细胞内的mRNA释放出来,从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获,并且每个探针都带有特异的位置序列,然后以mRNA为模版进行cDNA合成,构建文库后再通过测序,获得基因表达信息的同时,每一条测序reads因带有位置序列,从而能够获得基因表达的位置信息。
넶124 2024-05-17 -
动物组织标本病理检测的取材与保存方法
在科研动物实验中,经常涉及到动物组织的病理检测。然而,在做病理检测之前,往往容易忽视对组织标本的正确取材与保存。因此,根据病理检测方法不同,我整理了以下几点建议,以提高实验数据的有效性。
넶145 2024-05-14
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如何检测人体内的微塑料
由于塑料的广泛使用及不易降解(通常需要数百年的时间),塑料污染已是一个全球关注的问题,仅在 2020 年,就有 3.67 亿吨塑料被生产并使用[1]。通常塑料不会被人体直接吸收,随着检测手段的进步,科学家发现生产过程中小于5毫米的微塑料,或者被热力、氧化、生物降解等过程分解成的微纳米塑料颗粒(Micro- and nano-plastic particles,MNPs)都会被生物体吸收。
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空间转录组分析工具-seurat介绍
什么是空间转录组(ST)?以市面上最流行的10X为例:将冰冻组织切片(FF)或石蜡切片(FFPE)放置在10X Genomics Visium芯片的捕获区域内,进行HE染色和成像后,对组织切片进行透化处理,细胞内的mRNA释放出来,从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获,并且每个探针都带有特异的位置序列,然后以mRNA为模版进行cDNA合成,构建文库后再通过测序,获得基因表达信息的同时,每一条测序reads因带有位置序列,从而能够获得基因表达的位置信息。
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动物组织标本病理检测的取材与保存方法
在科研动物实验中,经常涉及到动物组织的病理检测。然而,在做病理检测之前,往往容易忽视对组织标本的正确取材与保存。因此,根据病理检测方法不同,我整理了以下几点建议,以提高实验数据的有效性。
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科学论文投稿之图片分辨率、图片宽度与文件大小
在科学论文投稿过程中,期刊通常对所提交的图片有一些要求,其中包括图片的分辨率、宽度和高度以及文件大小等方面。为了满足这些要求,需要考虑多个因素。下面将对这些概念进行解释,介绍它们之间的关系,并提供处理不符合要求情况的建议。